Rajout des éléments

Rajout après coup d'un titre : title("mon titre", cex.main = 0.8).

Rajout des axes après coup (si on a utilisé xaxt = "n" par exemple) :
axis(1, at = seq(10), labels = paste(paste("A", seq(10), sep = "")), tick = TRUE, col = "red", lwd = 2, lty = "dotted", las = 3, cex.axis = 0.8) :

1 : indique que c'est en bas du graphe (axe des x), 2 signifie à gauche (axe des ordonnées), 3 au-dessus et 4 à droite.
at = seq(10) : positions des graduations.
labels = paste(paste("A", seq(10), sep = "")) : noms des graduations (défaut si non précisé sont les valeurs)
tick = TRUE : indique ou non de tracer les ticks (défaut = TRUE).
col = "red" : couleur des graduations et de l'axe.
lwd = 2 : épaisseur des traits (axe et graduations).
lty = "dotted" : type de trait (axe et graduations).
las = 3 : noms de graduations verticales (cf paramètres des graphes).
cex.axis = 0.8 : facteur de grandissement des noms des graduations.

Rajout de la légende :

legend("topright", legend = c("A", "B"), col = c("red", "blue"), pch = 15, bty = "n", pt.cex = 2, cex = 0.8, text.col = "forestgreen", horiz = TRUE, inset = c(0.1, 0.1))

"topright" : met la légende en haut à gauche (autres valeurs permises : "bottomright", "bottom", "bottomleft", "left", "topleft", "top", "topright", "right", "center").
legend = c("A", "B") : indique les noms à faire figurer sur la légende (autant que de catégories).
col = c("red", "blue") : les couleurs des symboles de la légende.
pch = 15 : les symboles à utiliser (principe de recyclage comme d'habitude : ici, équivalent à pch = c(15, 15)).
bty = "n" : défaut est "o" avec une boîte d'encadrement, "n" sans boîte.
pt.cex = 2 : grandissement des symboles.
cex = 0.8 : grandissement du texte de la légende.
text.col = "forestgreen" : couleur du texte de la légende.
horiz = TRUE : légende en ligne (défaut en colonne).
inset = c(0.1, 0.1) : pourcentage (de 0 à 1) selon lequel la légende est éloignée des marges selon l'axe des X et l'axe des Y.
legend(..., ncol = 2) : légende sur 2 colonnes (ncol = (nbr + 5 - 1)) %/% 5 : nombre de colonnes pour en avoir toujours 5 par ligne).
On peut aussi préciser les coordonnées absolues de la position gauche de la légende : legend(3, 5, legend = c("A", "B")).

Rajout d'une grille :

grid(col = "red", lty = "dotted", lwd = 1) : rajoute une grille avec lignes en rouge pointillé d'épaisseur 1, à partir des ticks existants.
grid(nx = 10, ny = NA, col = "red", lty = "dotted") : rajoute 20 lignes verticales perpendiculaires à l'axe des x), et aucune verticale (perpendiculaires à l'axe des y).

Traçage de rectangles dans la zone du graphe :

  rect(seq(3, 4, 0.2), seq(1, 2, 0.2), seq(6, 5, -0.2), seq(2, 3, 0.2),
     col = c("pink", "lightblue"), border = "red",
     lty = c("solid", "dotted"), lwd = 2)

Rajout d'un boîte après coup sur un graphe :

box(col = "blue", lty = "dotted", lwd = 5) : rajoute une boîte en pointillés bleus autour du graphe.

Rajout après coup de droites :

abline(h = 3, col = "blue", lty = "dotted") : trace une droite horizontale bleue en pointillés à l'ordonnée 3.
abline(v = 2, col = "red") : trace une droite verticale rouge à l'abscisse 2.
abline(a = 1, b = 2, col = "green"): trace une droite d'ordonnée à l'origine 1 et de pente 2.

Rajout de la régression linéaire sur un nuage de points :

abline(lm(y ~ x), col = "red")

Rajout après coup de texte :

text(vectX, vectY, vectLabels) : rajoute au graphe aux positions x et y données par vectX et vectY (vecteurs de même taille) des étiquettes données par vectLabels (vecteur de type character de même taille).
text(vectX, vectY, vectLabels, pos = 1, col = "red", cex = 0.6, srt = 90) :
- pos = 1 : étiquette en dessous-du point (2 pour à gauche, 3 pour au-dessus, 4 pour à droite).
- col = "red" : étiquette en rouge.
- cex = 0.6 : taille de police multipliée par un facteur 0.6
- srt = 90 : étiquette tournée de 90 degrés.
text(vectX, vectY, vectLabels, adj = c(-0.5, 2)) : adj permet d'ajuster finement la position du texte par rapport au point comme alternative exclusive à pos :
- augmenter la première valeur pour aller vers la gauche.
- augmenter la deuxième valeur pour aller vers le bas.
Pour imprimer des étiquettes (ou des valeurs) au-dessus des barres d'un barplot (verticalement) : bar <- barplot(vect); text(bar, vect * 1.1, labels, srt = 90)
rajout de texte avec formule : text (5, 5, expression(paste(frac(1, sqrt(2 * pi * sigma^2))," ", e^{frac(-(x - mu)^2, 2 * sigma^2)})),cex=1.0)

Rajout de points :

points(seq(5), seq(5) / 2, pch = 21, col = "red", lwd = 2, cex = 0.8) : rajoute des points sur le graphe existant, avec les paramètres indiqués (voir les différents paramètres dans la section correspondante.
le premier vecteur donne les abcisses et le deuxième les ordonnées.

Rajout de segments :

ordre des coordonnées : segments(xDepart, yDepart, xArrivee, yArrivee)
segments(seq(5), seq(5) / 2, seq(5) / 2, seq(5) * 2, col = "red", lty = "dotted", lwd = 2) : rajoute des segments sur le graphe existant, avec les paramètres indiqués.
les deux premiers vecteurs indiquent les coordonnées x et y des points de départ et les deux suivants indiquent les coordonnées x et y des points d'arrivée.

Rajout de flèches :

arrows(seq(5), seq(5) / 2, seq(5) / 2, seq(5) * 2, col = "red", lty = "solid", lwd = 2, length = 0.2, angle = 45, code = 3) : trace des flèches sur le graphe existant, avec les paramètres indiqués.
Paramètres spécifiques pour les flèches :
- code : indique vers où vont les flèches : 2 pour aller du point de départ vers le point d'arrivée (défaut), 1 pour le sens inverse, et 3 pour avoir des flèches aux 2 bouts du segment.
- col, lty, lwd : paramètres habituels (voir section ad hoc).
- length : longueur de la tête de flèche en pouces.
- angle : angle de la tête de flèche en degrés par rapport au segment.

Rajout de polygones après coup :

lines(c(1, 2, 4), c(4, 6, 8), col = "red") : rajoute un polygone dont les sommets sont les points de coordonnées (1, 4), (2, 6) et (4, 8).
on peut modifier le tracé avec le type "both" (lignes et symbole) et d'épaisseur 2 : lines(c(1, 2), c(4, 6), type = "b", lwd = 2) (cf plot).

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