Test de Fisher exact

Test de Fisher exact : permet de tester si les fréquences entières observées sur 2 échantillons sont identiques ou non, même si les effectifs sont trop faibles pour un test du Chi2 (test d'un tableau de contigence) :

• mat <- matrix(c(70, 100, 150, 350), nrow = 2); tes <- fisher.test(mat) : renvoie un objet de type htest.
• La p-value est accessible par tes$p.value
• Par défaut, le test est sans a priori sur quel échantillon a une plus grande fréquence, mais on peut tester seulement un sens ou l'autre fisher.test(mat, alternative = "greater")
  • alternative = "two.sided" : défaut.
  • alternative = "greater" : deuxième plus grand que premier.
  • alternative = "less" : deuxième plus petit que premier.