Fonction dist

permet de calculer la matrice de distance entre les différentes lignes d'une matrice ou d'un vecteur :

• dist(c(4, 5, 3, 1)) : renvoie la matrice de distances entre chaque paire d'éléments.
• mat <- matrix(c(4, 5, 3, 1, 4, 5), nrow = 3); dist(mat) : renvoie la matrix de distances entre chaque paire de lignes de la matrice donnée.

Dans les deux cas, l'objet renvoyé est de la classe dist

dist(mat, diag = TRUE) : renvoie un objet dist, sauf que la diagonale est affichée (et elle est à 0).

dist(x, diag = TRUE, upper = TRUE) : renvoie un objet dist, sauf que la matrice complète est affchée (diagonale et demi-matrice supérieure).

as.matrix(myDist) : convertit en matrice un objet dist.

as.dist(myMatrix) : convertit en objet dist une matrice (en ne considérant que la sous-diagonale).

Différentes distances :

• dist(mat, method = "euclidean") : calcule la matrice de distance, avec la distance par défaut (euclidienne) et renvoie un objet de classe dist.
• dist(mat, method = "minkowski", p = 3) : distance avec la norme L3.
• dist(mat, method = "manhattan") : distance avec la norme L1.
• dist(mat, method = "maximum") : distance avec la norme L-infini (maxi de 2 composantes).
• dist(mat, method = "binary") : les vecteurs sont considérés comme binaires (1 si <> 0, 0 si 0) et la distance entre 2 vecteurs est la proportion de bits où seulement l'un des 2 est allumé sur le total où l'un au moins est allumé.